Шкрыль Юрий Николаевич
Кандидат наук (03.00.23 – биотехнология, Биолого-почвенный институт ДВО РАН), доцент
Уровень владения английским языком - В2-С1.
Направление подготовки и профиль образовательной программы, на которую будет приниматься аспирант
1.5.6 Биотехнология (биологические науки).
Перечень исследовательских проектов потенциального научного руководителя (участие/руководство)
Грант РФФИ, 11-04-98556-р_восток_а, «Кальцийзависимые протеинкиназы как новый инструмент метаболической инженерии растений», руководитель.
Грант ДВО РАН, 12-III-А-06-080, «Исследование молекулярных механизмов регуляции биосинтеза антрахинонов в трансгенных культурах марены сердцелистной Rubia cordifolia L.», руководитель.
Грант ДВО РАН, 15-I-6-102, «Изучение цитотоксического действия наночастиц металлов в системе клеток in vitro», руководитель.
Грант ДВО РАН, 18-3-045, «Разработка и исследование биомиметических принципов создания полупроводниковых и генетически кодируемых биосенсоров», руководитель.
Грант РФФИ, 19-34-90184 «Получение и свойства наночастиц металлов в системе клеток in vitro», руководитель.
Грант РНФ, 22-24-00082 «Функциональные свойства и биологическая роль онкогена rolB/C из природно-трансгенного сельскохозяйственного растения сладкого картофеля», руководитель.
Проект 6Н Передовой инженерной школы «Институт биотехнологий, биоинженерии и пищевых систем» ДВФУ, руководитель.Перечень предлагаемых соискателям тем для исследовательской работы
Гетерологичная экспрессия рекомбинантных белков в растениях и микроорганизмах;
Регуляция биосинтеза витаминов микробными продуцентами;
Создание рекомбинантных вакцин;
Регуляция биосинтеза низкомолекулярных соединений растений.
Научные интересы:
Молекулярная биология и биотехнология; генная и геномная инженерия растений, грибов и микроорганизмов; биомиметика, органические и неорганические наноструктуры; лекарственные соединения, вакцины и терапевтические белки.
Особенности исследования
Возможность проведения совместных исследований с индустриальным партнером ПИШ ДВФУ - компанией «Арника».
Требования потенциального научного руководителя
Высокий уровень знания базовых биологических дисциплин: молекулярная биология, технология рекомбинантных ДНК, микробиология и пр.
Базовое владение лабораторными методами: микроскопия, выделение нуклеиновых кислот, ПЦР.
Умение проводить статистическую обработку результатов исследования.
Уровень английского языка достаточный для свободного общения и письма.
Основные публикации потенциального научного руководителя
За последние 5 лет опубликовано 30 работ, включая 25 научных статей в журналах, индексируемых Web of Science (из которых 15 относятся к Q1), 4 статьи в издательствах Scopus и 1 статью в журнале списка RSCI.
Наиболее значимые работы:
1. Shkryl Y., Yugay Y., Avramenko T., Grigorchuk V., Gorpenchenko T., Grischenko O., Bulgakov V. (2021) CRISPR/Cas9-mediated knockout of HOS1 reveals its role in the regulation of secondary metabolism in Arabidopsis thaliana. Plants (Basel) 10:104. DOI: 10.3390/plants10010104.
2. Shkryl Y., Rusapetova T., Yugay Y., Egorova A., Silant’ev V., Grigorchuk V., Karabtsov A., Timofeeva Y., Vasyutkina E., Kudinova O., Ivanov V., Kumeiko V., Bulgakov V. (2021) Biosynthesis and cytotoxic properties of Ag, Au, and bimetallic nanoparticles synthesized using Lithospermum erythrorhizon callus culture extract // International Journal of Molecular Sciences. V.22, P.9305; DOI: 10.3390/ijms22179305.
3. Shkryl Y., Veremeichik G., Avramenko T., Gorpenchenko T., Tchernoded G., Bulgakov V. (2022) Transcriptional regulation of enzymes involved in ROS metabolism and abiotic stress resistance in rolC-transformed cell cultures. Plant Growth Regulation 97, 485-497. DOI: 10.1007/s10725-022-00812-1.
4. Shkryl Y., Yugay Y., Vasyutkina E., Chukhlomina E., Rusapetova T., Bulgakov V. (2022) The RolB/RolC homolog from sweet potato promotes early flowering and triggers premature leaf senescence in transgenic Arabidopsis thaliana plants // Plant Physiology and Biochemistry 193, 50–60. DOI: 10.1016/j.plaphy.2022.10.018.
5. Shkryl Y.N., Tchernoded G.K., Yugay Y.A., Grigorchuk V.P., Sorokina M.R., Gorpenchenko T.Y., Kudinova O.D., Degtyarenko A.I., Onishchenko M.S., Shved N.A., Kumeiko V.V., Bulgakov V.P. 2023. Enhanced Production of Nitrogenated Metabolites with Anticancer Potential in Aristolochia manshuriensis Hairy Root Cultures. International Journal of Molecular Sciences 24:11240. https://doi.org/10.3390/ijms241411240.Результаты интеллектуальной деятельности (последние 5 лет)
1. Патент РФ № 0002679390, 07.02.2019. Рекомбинантная плазмидная ДНК pSAT1-AhA1, кодирующая запасный белок А1 семян Amaranthus hypochondriacus, и рекомбинантный штамм Myceliophthora thermophila/pSAT1-AhA1 - продуцент запасного белка А1 // Балабанова Л.А., Шкрыль Ю.Н., Слепченко Л.В., Югай Ю.А., Подволоцкая А.Б., Сон О.М., Текутьева Л.А.
2. Патент РФ № 0002680295, 19.02.2019. Рекомбинантная плазмидная днк psat1-zmzeinb1, кодирующая кормовой белок альфа-зеин в1 кукурузы вида zea mays, и рекомбинантный штамм myceliophthora thermophila/psat1-zmzeinb1 - продуцент кормового белка альфа-зеин в1 // Текутьева Л.А., Балабанова Л.А., Сон О.М., Подволоцкая А.Б., Марченок М.В., Югай Ю.А., Слепченко Л.В., Шкрыль Ю.Н.
3. Патент РФ № RU 2756113 C1, 02.09.2020. Рекомбинантная плазмидная ДНК pMF230-GSMT/DMT, кодирующая химерный фермент биосинтеза бетаина, и рекомбинантный штамм Pseudomonas denitrificans/pMF230-GSMT/DMT - продуцент бетаина // Шкрыль Ю.Н., Балабанова Л.А., Дегтяренко А.И., Григорчук В.П., Слепченко Л.В., Марченок М.В., Подволоцкая А.Б., Сон О.М., Текутьева Л.А.